{"id":13628,"date":"2020-05-10T20:00:01","date_gmt":"2020-05-11T00:00:01","guid":{"rendered":"https:\/\/antilla-martinique.com\/?p=13628"},"modified":"2020-05-10T19:22:17","modified_gmt":"2020-05-10T23:22:17","slug":"pouvons-nous-nous-proteger-contre-le-coronavirus-en-reecrivant-nos-genomes","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/antilla-martinique.com\/en\/pouvons-nous-nous-proteger-contre-le-coronavirus-en-reecrivant-nos-genomes\/","title":{"rendered":"Pouvons-nous nous prot\u00e9ger contre le coronavirus en r\u00e9\u00e9crivant nos g\u00e9nomes?"},"content":{"rendered":"
\n
\n
\n
\n
\n

Pouvons-nous nous prot\u00e9ger contre le coronavirus en r\u00e9\u00e9crivant nos g\u00e9nomes?<\/h3>\n
\n

Le recodage du g\u00e9nome pourrait offrir de nouveaux modes de r\u00e9sistance aux virus, mais la technologie soul\u00e8ve de s\u00e9rieuses pr\u00e9occupations \u00e9thiques.<\/p>\n

Par: Sophie Fessl<\/a><\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n

\n
\n
\n
\n

Masques faciaux, distanciation sociale, verrouillage: Dans le monde entier, les pays se pr\u00e9cipitent pour arr\u00eater la transmission du nouveau coronavirus SARS-CoV-2 et pour att\u00e9nuer les effets d\u00e9vastateurs de COVID-19, la maladie qu’il provoque. Bien entendu, les scientifiques ont un r\u00f4le majeur \u00e0 jouer dans l’effort mondial, mod\u00e9lisant l’\u00e9pid\u00e9mie et aidant au d\u00e9veloppement de nouveaux m\u00e9dicaments.<\/p>\n

Mais un groupe de scientifiques a travaill\u00e9 sur un autre, une toute autre mani\u00e8re de faire face aux virus et de pr\u00e9venir les infections – en modifiant le g\u00e9nome humain. Lanc\u00e9 en 2016, \u00e0 la suite d’une r\u00e9union (quelque peu secr\u00e8te) de plus de 130 scientifiques, avocats et \u00e9thiciens \u00e0 la Harvard Medical School, le Human Genome Project-write (HGP-write) a pour but de synth\u00e9tiser et de modifier les g\u00e9nomes humains et autres. Le projet – qui porte le nom du Projet du g\u00e9nome humain, l’effort achev\u00e9 en 2003 pour s\u00e9quencer ou \u00ablire\u00bb le g\u00e9nome humain entier – visait \u00e0 l’origine \u00e0 synth\u00e9tiser le g\u00e9nome humain complet<\/a><\/span> – combinant chimiquement les \u00e9l\u00e9ments constitutifs de l’ADN pour cr\u00e9er synth\u00e9tiquement ce que nous existons tous naturellement.<\/p>\n

Plusieurs projets pilotes \u00e9taient pr\u00e9vus pour d\u00e9velopper la technologie pour y parvenir, notamment la cr\u00e9ation d’une lign\u00e9e cellulaire humaine r\u00e9sistante aux virus, la modification du g\u00e9nome porcin afin que les animaux puissent servir de donneurs d’organes humains et la construction de versions chromosomiques comme mod\u00e8les de cancer. Au fil du temps, le prix \u00e0 payer pour la synth\u00e8se d’ADN devrait baisser. Cependant, en 2018, comme le financement s’est av\u00e9r\u00e9 plus rare que pr\u00e9vu, le plan a \u00e9t\u00e9 r\u00e9duit dans un proche avenir: le premier objectif du projet serait de \u00ab\u00a0 recoder \u00a0\u00bb le g\u00e9nome humain, afin de produire des cellules immunis\u00e9es contre tout type d’infection virale. Cette immunit\u00e9 comprendrait les virus connus ainsi que les virus inconnus (comme le SRAS-CoV-2 avant 2020) – ou, en bref, tous les virus.<\/em><\/strong><\/p>\n

En 2018, le nom du projet avait \u00e9galement \u00e9t\u00e9 r\u00e9duit – en perdant le \u00abhumain\u00bb – \u00e0 seulement Genome Project-write, ou GP-write. Malgr\u00e9 la port\u00e9e r\u00e9duite, l’objectif est toujours ambitieux: dans le g\u00e9nome humain, ainsi que dans le g\u00e9nome de (presque) tous les autres \u00eatres vivants, chaque g\u00e8ne est \u00e9crit dans un \u00abalphabet \u00e0 quatre lettres\u00bb, avec les lettres correspondant \u00e0 quatre bases chimiques: l’ad\u00e9nine, la thymine, la guanine et la cytosine (souvent appel\u00e9es A, T, G et C). Recoder<\/a><\/span> signifierait changer la fa\u00e7on dont une cellule utilise et traduit ce code g\u00e9n\u00e9tique, un processus qui a \u00e9volu\u00e9 au cours de millions d’ann\u00e9es, dans le but de conf\u00e9rer une immunit\u00e9 virale.<\/p>\n

\u00a0 Optimiser l’alphabet de la nature<\/h3>\n

Le code g\u00e9n\u00e9tique contient des redondances apparentes. Les g\u00e8nes demandent \u00e0 la cellule de choisir parmi 20 acides amin\u00e9s, qui sont les \u00e9l\u00e9ments constitutifs des prot\u00e9ines. La fa\u00e7on dont la cellule encha\u00eene les acides amin\u00e9s pour former une prot\u00e9ine fonctionnelle est d\u00e9termin\u00e9e par des triplets de bases, appel\u00e9s codons. Le codon TCA, par exemple, repr\u00e9sente la s\u00e9rine d’acide amin\u00e9. Le TCA indique \u00e0 une partie de la machinerie cellulaire, l’ARNt, de saisir la s\u00e9rine et de l’ajouter \u00e0 la prot\u00e9ine en croissance. Un autre codon, TAC, lui dit de saisir et d’ajouter de la tyrosine. TAA, d’autre part, est un codon d’arr\u00eat, et dit \u00e0 la machinerie cellulaire d’arr\u00eater l’ajout d’acides amin\u00e9s. Mais AGT signifie \u00e9galement s\u00e9rine, tout comme un certain nombre d’autres combinaisons.<\/p>\n

GP-write propose d’optimiser ce code. L’optimisation signifierait que, parmi tous les codons codant pour la s\u00e9rine, un seul est s\u00e9lectionn\u00e9, par exemple le TCA. Toutes les instances de codons serine redondants, comme l’AGT, sont ensuite remplac\u00e9es par un codon choisi. Cela lib\u00e8re les codons redondants pour prendre en charge de nouvelles fonctions. Par exemple, un codon lib\u00e9r\u00e9 pourrait coder pour l’un des centaines d’acides amin\u00e9s l\u00e0-bas, plut\u00f4t que seulement les 20 que les \u00eatres vivants encha\u00eenent actuellement en prot\u00e9ines. Les organismes pourraient produire de nouvelles enzymes et d’autres prot\u00e9ines, contrairement \u00e0 celles produites par les \u00eatres vivants jusqu’\u00e0 pr\u00e9sent.<\/p>\n

\"\"
via Wikimedia Commons<\/a><\/figcaption><\/figure>\n

La r\u00e9attribution des codons pourrait rendre les cellules r\u00e9sistantes aux viru<\/b>s.<\/p>\n

Normalement, lorsqu’un virus p\u00e9n\u00e8tre dans une cellule, il d\u00e9tourne le m\u00e9canisme g\u00e9n\u00e9tique de la cellule pour produire plus de virus, qui sont ensuite lib\u00e9r\u00e9s dans le monde pour infecter les autres, par la toux, les \u00e9ternuements et d’autres moyens. Dans la cellule recod\u00e9e, la machinerie cellulaire a \u00e9t\u00e9 commut\u00e9e: l’ARNt qui saisirait la s\u00e9rine en r\u00e9ponse au codon AGT (redondant) est supprim\u00e9 et remplac\u00e9 par un nouvel ARNt, celui qui saisit un acide amin\u00e9 diff\u00e9rent lorsqu’il rencontre l’AGT. Lorsqu’un virus p\u00e9n\u00e8tre dans une cellule recod\u00e9e et tente de se reproduire via sa machinerie cellulaire, il ne peut tout simplement pas amener la cellule \u00e0 produire plus de virus. Soit la cellule ne reconna\u00eet plus l’AGT comme instruction pour la s\u00e9rine, soit elle ajoute un acide amin\u00e9 compl\u00e8tement diff\u00e9rent en r\u00e9ponse \u00e0 l’AGT \u2014 dans les deux cas, les prot\u00e9ines virales qui se forment ne sont pas fonctionnelles. Et donc l’infection s’arr\u00eate.<\/p>\n

Est-ce que cela fonctionnerait non seulement pour des cellules individuelles, mais pour des humains entiers? Un humain recod\u00e9 serait-il r\u00e9sistant \u00e0 tous les virus, pass\u00e9s, pr\u00e9sents et futurs? George Church, l’un des scientifiques \u00e0 la t\u00eate de GP-write (qui, soit dit en passant, est \u00e9galement int\u00e9ress\u00e9 \u00e0 ressusciter des mammouths disparus<\/span> ), l’a sugg\u00e9r\u00e9. Dans son livre de 2012, Regenesis: Comment la biologie synth\u00e9tique r\u00e9inventera la nature et nous-m\u00eames<\/em> , il \u00e9crit: \u00abL’une des plus grandes innovations en sant\u00e9 humaine de tous les temps serait de nous rendre r\u00e9sistants aux multivirus\u2026 Nous pourrions (\u00e9galement) atteindre une r\u00e9sistance aux multivirus en changeant notre g\u00e9n\u00e9tique code.\u00a0\u00bb<\/p>\n

En th\u00e9orie, ce qui fonctionne pour une cellule pourrait, apr\u00e8s de nouvelles \u00e9tapes d’optimisation, fonctionner pour un organisme. Ainsi, lorsque GP-write a \u00e9t\u00e9 lanc\u00e9 lors d’une r\u00e9union ferm\u00e9e aux m\u00e9dias et au public, des soup\u00e7ons ont surgi quant aux motivations des scientifiques participants.<\/p>\n

L’\u00e9thique du recodage<\/h2>\n

Avec l’objectif plus cibl\u00e9 de produire des cellules r\u00e9sistantes aux infections, annonc\u00e9 en 2018, la cr\u00e9ation d’humains r\u00e9sistants aux virus est hors de question. GP-write l’a pr\u00e9cis\u00e9 dans une \u00ab d\u00e9claration de principe<\/a><\/span> \u00bb de 2019 , qui d\u00e9clare que \u00able consortium\u2026 n’utilisera pas les technologies d’ing\u00e9nierie du g\u00e9nome pour cr\u00e9er ou modifier des embryons humains\u00bb.<\/p>\n

Mais les scientifiques poursuivent en disant: \u00abPourtant, la cr\u00e9ation \u00e9ventuelle d’une technologie d’ing\u00e9nierie du g\u00e9nome permettrait en principe de renforcer la capacit\u00e9<\/em> de concevoir le g\u00e9nome des cellules qui sont utilis\u00e9es pour cr\u00e9er et \/ ou modifier des embryons humains. N\u00e9anmoins, GP-write en tant que consortium s’est engag\u00e9 dans une politique qui ne le fera pas. \u00bb La d\u00e9claration a \u00e9t\u00e9 publi\u00e9e apr\u00e8s que la nouvelle a \u00e9t\u00e9 annonc\u00e9e que des scientifiques<\/a><\/span> affili\u00e9s \u00e0 GP-write voulaient cr\u00e9er une entreprise de cr\u00e9ation de b\u00e9b\u00e9s, m\u00eame si elle n’\u00e9tait pas li\u00e9e \u00e0 GP-write elle-m\u00eame.<\/p>\n