{"id":14386,"date":"2020-05-24T20:00:17","date_gmt":"2020-05-25T00:00:17","guid":{"rendered":"https:\/\/antilla-martinique.com\/?p=14386"},"modified":"2020-05-22T15:50:25","modified_gmt":"2020-05-22T19:50:25","slug":"parole-de-scientifique-1-le-coronavirus-sars-cov-2-peut-il-circuledans-lenvironnement","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/antilla-martinique.com\/en\/parole-de-scientifique-1-le-coronavirus-sars-cov-2-peut-il-circuledans-lenvironnement\/","title":{"rendered":"Parole de scientifique #1 : \u00ab Le coronavirus SARS-CoV-2 peut-il circuler dans l\u2019environnement ? \u00bb"},"content":{"rendered":"<header><\/header>\n<h2><strong style=\"font-size: 16px\">Trois questions \u00e0 \u00a0virologiste et responsable du laboratoire Sant\u00e9 environnement et microbiologie de l\u2019Ifremer \u00e0\u00a0Nantes<\/strong><\/h2>\n<p>Dans le cadre du projet europ\u00e9en VEO \u00ab\u00a0Observatoire polyvalent des maladies infectieuses \u00e9mergentes \u00bb, Soizick Le Guyader et son \u00e9quipe d\u00e9marrent des travaux sur la circulation des virus \u00e9mergents dans l&rsquo;environnement. Hasard de calendrier, ce projet coordonn\u00e9 par une \u00e9quipe n\u00e9erlandaise a d\u00e9but\u00e9 quelques semaines avant la pand\u00e9mie. Les chercheurs des 12 pays europ\u00e9ens impliqu\u00e9s ont donc d\u00e9cid\u00e9 dans un premier temps d\u2019axer leurs travaux sur <strong>le virus SARS-CoV-2<\/strong> responsable de la maladie <strong>covid-19<\/strong>.<\/p>\n<h3><strong>1) Le SARS-CoV-2 peut-il \u00eatre pr\u00e9sent dans l\u2019eau et contaminer l\u2019environnement marin\u00a0?<\/strong><\/h3>\n<p><em>Nous manquons d\u2019informations sur le devenir du coronavirus dans l\u2019environnement marin, car son apparition est r\u00e9cente. Nous savons toutefois que ce virus \u00ab\u00a0envelopp\u00e9\u00a0\u00bb est assez fragile et qu\u2019il est peu excr\u00e9t\u00e9 dans les selles des personnes infect\u00e9es. <strong>Le risque qu\u2019il se diss\u00e9mine via les eaux us\u00e9es est donc r\u00e9duit<\/strong>. <\/em>Deux publications ont n\u00e9anmoins rapport\u00e9 la d\u00e9tection du SARS-CoV-2 dans des eaux us\u00e9es au Pays-Bas et dans le r\u00e9seau d\u2019eau non potable de Paris. <strong>L\u2019Ifremer a donc d\u00e9cid\u00e9 d\u2019investiguer<\/strong> pour savoir si ce virus peut \u00eatre retrouv\u00e9 jusqu\u2019\u00e0 la mer.<\/p>\n<aside class=\"embed embed-aside mode-embed type-image size-content_embed_medium pull-left\" data-size=\"0px;0px\">\n<h6 class=\"embed-inner\"><a class=\"layer-content mfp-image\" style=\"background-color: transparent;color: #2e78a4;text-decoration: none\" href=\"https:\/\/wwz.ifremer.fr\/var\/storage\/images\/_aliases\/fullsize\/medias-ifremer\/medias-institut\/l-ocean-pour-tous\/parole-de-scientifique\/portrait-de-soizick-le-guyader\/1751449-1-fre-FR\/Portrait-de-Soizick-LE-GUYADER.jpg\" data-layer-type=\"image\" data-layer-title=\"Portrait de Soizick LE GUYADER\" data-layer-copyright=\"&lt;p&gt;\u00a9\u00a0Pierre Maraval&lt;\/p&gt;\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" class=\"img-responsive\" title=\"\u00a9\u00a0Pierre Maraval\" src=\"https:\/\/wwz.ifremer.fr\/var\/storage\/images\/_aliases\/content_embed_medium\/medias-ifremer\/medias-institut\/l-ocean-pour-tous\/parole-de-scientifique\/portrait-de-soizick-le-guyader\/1751449-1-fre-FR\/Portrait-de-Soizick-LE-GUYADER.jpg\" alt=\"Portrait Soizick LE GUYADER\" width=\"377\" height=\"566\" \/><\/a>Portrait de Soizick LE GUYADER<small>\u00a9\u00a0Pierre Maraval<\/small><\/h6>\n<\/aside>\n<h3><strong>2) Comment allez-vous \u00e9valuer ce risque de contamination\u00a0?<\/strong><\/h3>\n<p>Nous avons d\u2019ores et d\u00e9j\u00e0 re\u00e7u les pr\u00e9l\u00e8vements de deux stations d\u2019\u00e9puration\u00a0: l\u2019une urbaine, l\u2019autre proche du littoral. Des pr\u00e9l\u00e8vements de coquillages sont \u00e9galement pr\u00e9vus. <strong>Nous affinons actuellement notre protocole de recherche du SRAS-CoV-2<\/strong> afin d\u2019assurer la fiabilit\u00e9 de nos analyses. Ce protocole par PCR* est semblable \u00e0 celui utilis\u00e9 pour le d\u00e9pistage des patients. Il permet de d\u00e9tecter le g\u00e9nome du virus et de mesurer la quantit\u00e9 totale d\u2019ARN** viral pr\u00e9sente dans les \u00e9chantillons.<\/p>\n<p>Peu de gens savent que <strong>l\u2019analyse des eaux us\u00e9es donne une image \u00ab\u00a0fid\u00e8le\u00a0\u00bb de la diversit\u00e9 des microorganismes<\/strong> (dont les virus) pr\u00e9sents dans la population. C\u2019est un moyen int\u00e9ressant, et compl\u00e9mentaire du d\u00e9pistage, pour estimer la part de la population infect\u00e9e et le niveau r\u00e9el de circulation du virus dans un territoire.<\/p>\n<h3><strong>3) Si vous trouviez de l\u2019ARN viral dans les eaux us\u00e9es ou dans les coquillages, que feriez-vous\u00a0?<\/strong><\/h3>\n<p>L\u2019urgence serait alors de savoir si cet ARN viral est li\u00e9 \u00e0 la pr\u00e9sence de virus entiers infectieux ou de fragments inoffensifs pour la sant\u00e9 issus de la d\u00e9gradation du virus dans les eaux us\u00e9es ou dans le milieu marin. Pour cela, l\u2019Ifremer collaborerait avec des partenaires ext\u00e9rieurs \u2014 notamment l\u2019Institut Pasteur et le laboratoire europ\u00e9en de biologie mol\u00e9culaire (EMBL)\u00a0\u2014 \u00e9quip\u00e9s de laboratoires hautement s\u00e9curis\u00e9s. <strong>Si des virus infectieux \u00e9taient d\u00e9tect\u00e9s, nous chercherions \u00e0 savoir combien de temps ils pourraient rester actifs et potentiellement contaminer l\u2019eau et les coquillages.<\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<ul>\n<li>Ce protocole par amplification en cha\u00eene par polym\u00e9rase (PCR en anglais) permet de cr\u00e9er un grand nombre de copies d\u2019une s\u00e9quence d\u2019ADN ou d\u2019ARN.<\/li>\n<\/ul>\n<p>** ARN\u00a0: acide ribonucl\u00e9ique. C\u2019est le mat\u00e9riel g\u00e9n\u00e9tique de ce type de virus dits \u00e0 ARN.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Trois questions \u00e0 \u00a0virologiste et responsable du laboratoire Sant\u00e9 environnement et microbiologie de l\u2019Ifremer \u00e0\u00a0Nantes Dans le cadre du projet europ\u00e9en VEO \u00ab\u00a0Observatoire polyvalent des maladies infectieuses \u00e9mergentes \u00bb, Soizick Le Guyader et son \u00e9quipe d\u00e9marrent des travaux sur la circulation des virus \u00e9mergents dans l&rsquo;environnement. 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