{"id":15153,"date":"2020-06-11T20:00:42","date_gmt":"2020-06-12T00:00:42","guid":{"rendered":"https:\/\/antilla-martinique.com\/?p=15153"},"modified":"2020-06-10T17:38:18","modified_gmt":"2020-06-10T21:38:18","slug":"le-deconfinement-produit-des-clusters-et-ils-pourraient-se-reveler-utiles","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/antilla-martinique.com\/en\/le-deconfinement-produit-des-clusters-et-ils-pourraient-se-reveler-utiles\/","title":{"rendered":"Le d\u00e9confinement produit des clusters (et ils pourraient se r\u00e9v\u00e9ler utiles)"},"content":{"rendered":"
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Ces foyers de contamination s’expliquent par un ph\u00e9nom\u00e8ne \u00e9tonnant: le coronavirus est propag\u00e9 par une partie tr\u00e8s faible de personnes atteintes du Covid-19.<\/h2>\n<\/div>\n
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Par Gr\u00e9gory Rozi\u00e8res<\/span><\/a><\/span><\/div>\n<\/div>\n
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SANT\u00c9 PUBLIQUE FRANCE<\/span><\/div>\n<\/div>
Les 109 clusters o\u00f9 le coronavirus circule en France.<\/figcaption><\/figure>\n
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SCIENCE – \u201cDepuis 7 semaines, les indicateurs \u00e9pid\u00e9miologiques sont en baisse ou se maintiennent\u201d. C\u2019est par cette phrase rassurante que Sant\u00e9 Publique France (SPF) commence son rapport hebdomadaire du 29 mai sur l\u2019\u00e9pid\u00e9mie de Covid-19 en France.<\/p>\n

Si le d\u00e9confinement<\/a> ne semble pas avoir permis au coronavirus de reprendre du terrain, SPF note tout de m\u00eame\u00a0\u201cune augmentation du nombre de clusters<\/a>\u201d. 109 ont \u00e9t\u00e9 signal\u00e9s au 27 mai<\/a>. Un cluster, c\u2019est \u201cla survenue d\u2019au moins 3 cas confirm\u00e9s ou probables\u201d de Covid-19 en une semaine, que l\u2019on peut lier entre eux. 64% des clusters ont plus de 5 cas.<\/p>\n

Mais pourquoi et comment se forme un cluster? Quels sont leurs r\u00f4les dans l\u2019\u00e9pid\u00e9mie? Pour r\u00e9pondre \u00e0 ces questions, il faut bien comprendre que le coronavirus Sars-Cov2<\/a> ne se r\u00e9pand pas de mani\u00e8re uniforme.<\/p>\n

On parle beaucoup du R0, le taux de contamination, qui d\u00e9crit le nombre de personnes contamin\u00e9es par un infect\u00e9. \u201cMais ce R0 est une moyenne, chaque personne en contamine en r\u00e9alit\u00e9 un nombre al\u00e9atoire\u201d,\u00a0explique au HuffPost<\/em>Jean-St\u00e9phane Dhersin, chercheur CNRS, math\u00e9maticien \u00e0 l\u2019universit\u00e9 Sorbonne Paris Nord, sp\u00e9cialiste en mod\u00e9lisations des \u00e9pid\u00e9mies.<\/p>\n

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C\u2019est pour cela que m\u00eame si le virus circule, il n\u2019est jamais certain que l\u2019\u00e9pid\u00e9mie prenne, il y a une part de hasard pour chaque contamination. \u201cC\u2019est comme si vous lancez un d\u00e9, vous ne pouvez pas conna\u00eetre le r\u00e9sultat\u201d, simplifie-t-il. Mais une fois l\u2019\u00e9pid\u00e9mie lanc\u00e9e, tout devient plus clair: \u201cSi vous lancez 1000 d\u00e9s, vous savez que le r\u00e9sultat sera d\u2019environ 3500, c\u2019est la loi des grands nombres\u2033.<\/p>\n

Super contamination<\/h2>\n

Dans certains cas, un infect\u00e9 ne va entra\u00eener aucun nouveau cas. Dans d\u2019autres, plus rares, il va contaminer des dizaines de personnes. C\u2019est ce que l\u2019on appelle un \u00e9pisode de super contamination (super spreading).<\/p>\n

Avant l\u2019\u00e9pid\u00e9mie de Covid-19, on avait d\u00e9j\u00e0 remarqu\u00e9 des ph\u00e9nom\u00e8nes similaires pour d\u2019autres maladies, notamment le Sars, un autre coronavirus qui a \u00e9merg\u00e9 en 2003. \u201cOn a par exemple \u00e0 Ta\u00efwan en 2003 un homme de 43 ans qui a entra\u00een\u00e9 l\u2019infection de 137 personnes\u201d, d\u00e9taille Jean-Claude Manuguerra, responsable de la Cellule d\u2019Intervention Biologique d\u2019Urgence \u00e0 l\u2019Institut Pasteur, interrog\u00e9 par Le HuffPost<\/em>. Une autre personne de 26 ans en a contamin\u00e9 112.<\/p>\n

Pourtant, le taux moyen est situ\u00e9 aux alentours de 2. Ce qui veut dire que beaucoup de personnes n\u2019en infectent aucune. \u201cAu d\u00e9part, on a parl\u00e9 de super contaminateurs, mais on s\u2019est rendu compte que ce sont majoritairement les circonstances qui rendent cela possible, plut\u00f4t que l\u2019individu\u201d, rappelle Jean-Claude Manuguerra. C\u2019est pour cela que l\u2019on parle plut\u00f4t d\u2019un \u00e9pisode de super contamination.<\/p>\n

Pour le coronavirus Sars-Cov2, c\u2019est un peu pareil. De plus en plus d\u2019\u00e9tudes de cas nous montrent qu\u2019il existe des \u00e9pisodes de super contamination. Le plus c\u00e9l\u00e8bre est le \u201cpatient 31\u201d qui contamina des dizaines de personnes en Cor\u00e9e du Sud et entra\u00eena la cr\u00e9ation d\u2019un cluster de plus de 5000 cas<\/a>. Plus r\u00e9cemment \u00e0 S\u00e9oul, un infect\u00e9 s\u2019est rendu dans 5 bo\u00eetes de nuit et a entra\u00een\u00e9 l\u2019infection d\u2019au moins 150 personnes<\/a>.<\/p>\n

Une study<\/a>\u00a0(non revue par des pairs) analysant l\u2019\u00e9pid\u00e9mie \u00e0 Hong-kong a conclu que 80% des contaminations sont dues \u00e0 seulement 20% des infect\u00e9s. Le graphique ci-dessous montre quelles personnes ont contamin\u00e9 qui, dans diff\u00e9rents clusters.<\/p>\n<\/div>\n

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WU ET AL.<\/span><\/div>\n<\/div>
Les diff\u00e9rents clusters trac\u00e9s \u00e0 Hong Kong.<\/figcaption><\/figure>\n
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Une autre study<\/a>\u00a0(l\u00e0 encore non revue par des pairs), qui a analys\u00e9 les cas import\u00e9s et locaux en dehors de la Chine, estime qu\u2019environ 10% des infect\u00e9s sont responsables de 80% des contaminations secondaires.<\/p>\n

Des causes diverses et mal comprises<\/h2>\n

Mais pourquoi certaines personnes contaminent-elles plus de monde? Dans une study<\/a>\u00a0partielle mise en ligne le 27 mai, une \u00e9quipe de chercheurs a justement tent\u00e9 d\u2019analyser en d\u00e9tail ce ph\u00e9nom\u00e8ne al\u00e9atoire, appel\u00e9 \u201cstochasticit\u00e9\u201d. Ces scientifiques listent 4 types de causes possibles pour un \u00e9pisode de super contamination.<\/p>\n

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  1. Biologique: les individus ont plus de chance d\u2019infecter quelqu\u2019un. Cela peut \u00eatre d\u00fb au fait qu\u2019ils ont plus de virus \u00e0 propager quand ils respirent, parlent ou toussent. Plusieurs<\/a>\u00e9tudes<\/a> semblent indiquer que nous sommes plus contaminants quelques jours avant et apr\u00e8s le d\u00e9but des sympt\u00f4mes.<\/li>\n
  2. Comportement: \u201cLes individus causant des \u00e9v\u00e9nements de super contamination peuvent avoir un plus grand nombre de contacts\u201d.<\/li>\n
  3. Environnement: certains lieux sont plus susceptibles de permettre la propagation du virus. On sait par exemple que le virus semble contaminer plus facilement \u00e0 l\u2019int\u00e9rieur qu\u2019\u00e0 l\u2019ext\u00e9rieur<\/a>, et encore plus dans les abattoirs<\/a>, the salles de sport<\/a>, etc.<\/li>\n
  4. Les circonstances particuli\u00e8res, comme le regroupement massif de nombreuses personnes, augmentant drastiquement le nombre de contacts, ou encore le fait de chanter ou de parler fort en public, entra\u00eenant plus de propagations des particules virales.<\/li>\n<\/ol>\n

    Quand une personne en contamine des dizaines d\u2019autres, c\u2019est certainement une combinaison de facteurs qui est \u00e0 l\u2019oeuvre, avant tout li\u00e9e aux circonstances. \u201cIl peut y avoir des gens plus transmetteurs, mais c\u2019est surtout la nature, le temps et le nombre de contacts qui va avoir un effet\u201d, explique Jean-Claude Manuguerra.<\/p>\n

    Un suivi des clusters doublement important<\/h2>\n

    Tous ces \u00e9l\u00e9ments permettent de comprendre pourquoi certains infect\u00e9s ont entra\u00een\u00e9 la cr\u00e9ation de l\u2019un des 109 clusters signal\u00e9s en France. Il n\u2019y a rien d\u2019anormal l\u00e0-dedans. \u201cLes clusters existaient avant, mais aujourd\u2019hui, on les voit\u201d, rappelle Jean-St\u00e9phane Dhersin. \u201cCe sont ces clusters qui permettent \u00e0 une \u00e9pid\u00e9mie de d\u00e9marrer\u201d.<\/p>\n

    Car \u201caujourd\u2019hui, ce que l\u2019on vit ressemble plus \u00e0 un d\u00e9but qu\u2019\u00e0 une fin d\u2019\u00e9pid\u00e9mie\u201d, estime le chercheur. En effet, de rares cas sont signal\u00e9s un peu partout, et dans quelques situations encore plus rares, ces infect\u00e9s en contaminent d\u2019autres.<\/p>\n

    C\u2019est pour cela que les autorit\u00e9s les scrutent et tentent de les endiguer, en isolant les personnes infect\u00e9es et leurs contacts<\/a>. Mais paradoxalement, les clusters et les \u00e9pisodes de super contamination pourraient aussi nous permettre de mieux comprendre le coronavirus, voire nous aider \u00e0 lutter contre l\u2019\u00e9pid\u00e9mie sans avoir \u00e0 passer par la phase confinement.<\/p>\n

    Car si nous connaissons de mieux en mieux le coronavirus Sars-Cov2, il existe encore beaucoup d\u2019incertitudes. La maladie semble se propager mieux \u00e0 l\u2019int\u00e9rieur qu\u2019en ext\u00e9rieur, mais \u00e0 quel point? Quelle est la part des a\u00e9rosols (de l\u2019air) dans la contamination? Une \u00e9tude<\/a> a par exemple montr\u00e9 que des familles ont \u00e9t\u00e9 contamin\u00e9es dans un restaurant alors qu\u2019elles n\u2019\u00e9taient pas assez proches de la personne infect\u00e9e pour \u00eatre touch\u00e9e, sauf par l\u2019air ventil\u00e9 par la climatisation.<\/p>\n

    Mieux \u00e9tudier les nouveaux cas, dans les clusters et ailleurs, nous donnera des \u00e9l\u00e9ments pour r\u00e9pondre \u00e0 ces questions. En comprenant les types de transmission et les situations \u00e0 risque, il nous serait donc possible de mieux comprendre quelles sont les mesures les plus efficaces pour emp\u00eacher la propagation du coronavirus.<\/p>\n

    Car face \u00e0 la fulgurance de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie, la plupart des pays ont activ\u00e9 dans un temps tr\u00e8s r\u00e9duit des mesures tr\u00e8s diff\u00e9rentes (distanciation sociale, masques, fermeture des \u00e9coles, restaurants et lieux publics, interdiction des rassemblements, etc.), voire des confinements g\u00e9n\u00e9ralis\u00e9s. Difficile dans ces conditions de savoir si certaines mesures cl\u00e9s ont permis, plus que d\u2019autres, de ma\u00eetriser l\u2019\u00e9pid\u00e9mie.<\/p>\n

    \u00c0 voir \u00e9galement sur Le HuffPost<\/em>:\u00a0Comment contr\u00f4ler une \u00e9pid\u00e9mie, mode d\u2019emploi<\/em><\/strong><\/p>\n<\/div>\n

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