{"id":19109,"date":"2020-10-13T02:39:20","date_gmt":"2020-10-13T06:39:20","guid":{"rendered":"https:\/\/antilla-martinique.com\/?p=19109"},"modified":"2020-10-13T02:39:20","modified_gmt":"2020-10-13T06:39:20","slug":"covid-19-peut-on-parler-dune-surmutation-avec-7-versions-differentes-du-virus-publie-le-13-10-2020","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/antilla-martinique.com\/en\/covid-19-peut-on-parler-dune-surmutation-avec-7-versions-differentes-du-virus-publie-le-13-10-2020\/","title":{"rendered":"Covid-19 : peut-on parler d\u2019une \u00ab\u00a0surmutation\u00a0\u00bb, avec 7 versions diff\u00e9rentes du virus ? (Publi\u00e9 le 13\/10\/2020)."},"content":{"rendered":"
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Le virus n’a que tr\u00e8s peu \u00e9volu\u00e9 depuis le d\u00e9but de l’ann\u00e9e\u00a0\u2212\u00a0Illustration South_agency via iStock
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VARIATIONS MINIMES – Dans un entretien \u00e0 la radio, Didier Raoult a expliqu\u00e9 que le SARS-CoV-2 avait mut\u00e9 de mani\u00e8re significative. Il identifie 7 \u00ab\u00a0mutants\u00a0\u00bb avec ses \u00e9quipes, assez \u00e9loign\u00e9s de la version originelle du virus import\u00e9e de Chine au d\u00e9but de l’ann\u00e9e. Des conclusions qui m\u00e9ritent d’\u00eatre largement nuanc\u00e9es.<\/h4>\n<\/header>\n
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Thomas Deszpot
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Invit\u00e9 de la matinale de Radio Classique, le Pr Didier Raoult s’est exprim\u00e9 au sujet des mutations subies par le virus. \u00c0 Marseille, avec ses \u00e9quipes, il indique avoir \u00ab\u00a0beaucoup plus de donn\u00e9es que n’importe qui au monde en ce moment, en particulier sur les s\u00e9quences de g\u00e9nomes\u00a0\u00bb<\/em>. Des g\u00e9nomes compar\u00e9s avec ceux observ\u00e9s il y a plusieurs mois afin de cerner d’\u00e9ventuelles \u00e9volutions. \u00ab\u00a0Depuis juillet\u00a0\u00bb<\/em>, poursuit-il, \u00ab\u00a0depuis l’apparition de ce deuxi\u00e8me acte, les g\u00e9nomes que nous avons ne sont pas les m\u00eames que ceux que nous avions avant, ce qui est peut-\u00eatre la raison pour laquelle la mortalit\u00e9 est beaucoup plus faible que ce que l’on avait avant.\u00a0\u00bb<\/em> <\/p>\n

Didier Raoult livre ensuite des pr\u00e9cisions<\/a> : \u00ab\u00a0Oui, le virus mute et il n’y a pas un seul virus, qui a mut\u00e9. Actuellement, nous avons 7 mutants, qui ont circul\u00e9 et qui ont une distance par rapport au virus original beaucoup plus grande que la distance qu’avaient les virus pendant la p\u00e9riode de f\u00e9vrier mars avril. Ce virus a une surmutation si vous voulez.\u00a0\u00bb<\/em> Des d\u00e9clarations qui font \u00e9cho \u00e0 une s\u00e9rie de d\u00e9couvertes r\u00e9alis\u00e9es par les chercheurs, mais qui m\u00e9ritent n\u00e9anmoins des pr\u00e9cisions et se r\u00e9v\u00e8lent teint\u00e9es de quelques exag\u00e9rations.<\/p>\n<\/section>\n

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Des modifications \u00e0 relativiser<\/h4>\n<\/div>\n
Pour mieux analyser les informations transmises par le Pr Raoult, LCI a sollicit\u00e9 Etienne Simon-Lori\u00e8re, responsable du laboratoire de g\u00e9nomique \u00e9volutive des virus \u00e0 ARN pour l’Institut Pasteur. Avant de se pencher sur la question des mutations du virus, il fait part de son \u00e9tonnement quant au fait que les \u00e9quipes de l’IHU \u00e0 Marseille disposeraient de beaucoup plus de donn\u00e9es que quiconque \u00e0 travers le monde. \u00ab\u00a0C’est une phrase assez curieuse, car la France ne figure pas parmi les pays qui proc\u00e8dent le plus \u00e0 des s\u00e9quen\u00e7ages. Au contraire de l’Angleterre, qui a d\u00e9pos\u00e9 plus de 40.000 g\u00e9nomes, on n’en recense que quelques centaines en France. Si vraiment ils disposent de beaucoup de donn\u00e9es, ce serait assez g\u00eanant d’observer qu’ils ne les aient pas d\u00e9pos\u00e9es\u00a0\u00bb<\/em>, les rendant ainsi accessibles \u00e0 tous les autres chercheurs.Cet apart\u00e9 mis \u00e0 part, Etienne Simon-Lori\u00e8re observe-t-il un changement majeur du virus dans le temps ? Pas n\u00e9cessairement. Pour les versions du virus les plus \u00e9loign\u00e9es de l’originale, seuls \u00ab\u00a020 \u00e0 22 s\u00e9quences qui diff\u00e9raient\u00a0\u00bb<\/em> ont \u00e9t\u00e9 recens\u00e9s, note le sp\u00e9cialiste. Un chiffre \u00e0 rapporter aux quelque 30.000 bases comptabilis\u00e9es et pass\u00e9es au crible pour ce virus. Surtout, \u00ab\u00a0dans les pays o\u00f9 l’on s\u00e9quence beaucoup, il appara\u00eet que l’on n’observe pas de diff\u00e9rences majeures qui seraient associ\u00e9es \u00e0 un changement du comportement du virus\u00a0\u00bb<\/em>. Pas de \u00ab\u00a0changement ph\u00e9notypique\u00a0\u00bb<\/em> notable donc, selon le terme qu’utilisent les scientifiques.<\/p>\n

Emma Hodcroft, postdoctorante au biocentre de l\u2019Universit\u00e9 de B\u00e2le, suit elle aussi les \u00e9volutions du virus et rappelle<\/a> dans les colonnes du journal Le Temps<\/em> que le SARS-CoV-2, comme tous les coronavirus, mute lentement. \u00ab\u00a0Un coronavirus qui a mut\u00e9 aura toujours plus de similitudes que de diff\u00e9rences compar\u00e9 \u00e0 une variante pr\u00e9c\u00e9dente\u00a0\u00bb<\/em>, souligne-t-elle, \u00ab\u00a0tout comme l\u2019arriv\u00e9e d\u2019un nouveau b\u00e9b\u00e9 ne signifie pas l\u2019apparition d\u2019une nouvelle souche d\u2019\u00eatres humains.\u00a0\u00bb<\/em><\/p>\n<\/section>\n

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Etienne Simon-Lori\u00e8re a \u00e9t\u00e9 surpris par l’usage du terme \u00ab\u00a0surmutation\u00a0\u00bb<\/em> par Didier Raoult, qui \u00ab\u00a0n’a pas de sens\u00a0\u00bb<\/em> \u00e0 ses yeux. Il explique en effet que \u00ab\u00a0l’on observe simplement des mutations qui s’accumulent au fil du temps, ce qui est tr\u00e8s classique avec ce type de virus\u00a0\u00bb<\/em>. Celui-ci subit d’ailleurs moins de mutations que d’autres, et avait \u00e9t\u00e9 qualifi\u00e9 ces derniers mois de relativement \u00ab\u00a0stable\u00a0\u00bb<\/em>.<\/section>\n
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Pas d’\u00e9volution notable de la dangerosit\u00e9<\/h3>\n<\/blockquote>\n
Pour l’expert de l’Institut Pasteur estime que le nombre de sept \u00ab\u00a0mutants\u00a0\u00bb <\/em>\u00e9tabli par les \u00e9quipes de l’IHU de Marseille \u00ab\u00a0est totalement arbitraire\u00a0\u00bb. <\/em>Et pour cause : les chercheurs peuvent observer<\/a> les diff\u00e9rentes \u00ab\u00a0variants\u00a0\u00bb du g\u00e9nome, avec les diff\u00e9rences mineures qui les singularisent. Ce sont eux qui, \u00e0 partir de ces diff\u00e9rences, choisissent de rassembler entre elles certaines versions, qui pr\u00e9sentent de nombreux traits communs. \u00c0 la mani\u00e8re d’un arbre g\u00e9n\u00e9alogique. \u00ab\u00a0Plusieurs sch\u00e9mas sont utilis\u00e9s, et certains pr\u00e9f\u00e8rent ainsi retenir 5 branches plut\u00f4t que 7\u00a0\u00bb<\/em>.Quoi qu’il en soit, \u00ab\u00a0sur le plan biologique et infectieux, c’est le m\u00eame virus\u00a0\u00bb<\/em>, tranche Etienne Simon-Lori\u00e8re, \u00ab\u00a0et l’on observe qu’il se comporte \u00e0 quelques d\u00e9tails pr\u00e8s de la m\u00eame mani\u00e8re qu’au d\u00e9but de l’\u00e9pid\u00e9mie\u00a0\u00bb<\/em>. Une bonne nouvelle dans la perspective d’un vaccin, puisque le sp\u00e9cialiste pr\u00e9cise que \u00ab\u00a0m\u00eame des virus pr\u00e9sentant des mutations circulent, celles-ci n’auront pas d’impact sur l’efficacit\u00e9 d’une vaccination.\u00a0\u00bb <\/em>Cette analyse rejoint celle de chercheurs outre-Atlantique, qui ont publi\u00e9 une \u00e9tude<\/a> dans la revue de l’Acad\u00e9mie nationale des sciences des \u00c9tats-Unis. \u00ab\u00a0Nous constatons une diversit\u00e9 limit\u00e9e dans les g\u00e9nomes du SRAS-CoV-2\u00a0\u00bb<\/em>, \u00e9crivent-ils, ajoutant que le virus \u00ab\u00a0se transmet plus rapidement qu’il n’\u00e9volue\u00a0\u00bb<\/em>, ce qui rend \u00ab\u00a0la population virale plus homog\u00e8ne\u00a0\u00bb<\/em>. Du fait de cette \u00ab\u00a0diversit\u00e9 minimale\u00a0\u00bb<\/em>, les chercheurs estiment eux aussi qu’un seul et m\u00eame vaccin sera suffisant pour se r\u00e9v\u00e9ler \u00ab\u00a0efficace contre les lign\u00e9es du virus actuellement en circulation\u00a0\u00bb<\/em>.<\/p>\n

Les scientifiques continuent n\u00e9anmoins \u00e0 traquer les \u00e9volutions g\u00e9nomiques du SARS-CoV-2, afin notamment de s’assurer que les tests de d\u00e9tection soient toujours aussi efficaces. Si les s\u00e9quences pr\u00e9cises que les laboratoires tentent de d\u00e9tecter \u00e9voluent, il sera en effet n\u00e9cessaire d’adapter les outils de test en cons\u00e9quence pour \u00e9viter que des patients atteints du virus ne soient diagnostiqu\u00e9s comme sains. Il y a quelques semaines, une mutation pr\u00e9cise (r\u00e9pertori\u00e9e sous le nom de D614G) a notamment attir\u00e9 les regards, suspect\u00e9e de rendre moins dangereux le virus. \u00ab\u00a0Si D614G a suscit\u00e9 autant de discussions, c\u2019est parce qu\u2019il s\u2019agit d\u2019une prot\u00e9ine \u00e0 l\u2019interface entre le virus et son h\u00f4te\u00a0\u00bb<\/em>, analyse<\/a> aupr\u00e8s du Temps<\/em> Fran\u00e7ois Balloux, directeur de l\u2019Institut de g\u00e9n\u00e9tique de l\u2019University College de Londres. \u00ab\u00a0Il faut n\u00e9anmoins signaler que les diff\u00e9rences de charge virale observ\u00e9es entre les patients pr\u00e9sentant cette mutation et les autres sont tr\u00e8s faibles.\u00a0\u00bb<\/em><\/p>\n

En r\u00e9sum\u00e9, il est exact de dire que le Covid-19 a subi des mutations depuis le d\u00e9but de l’ann\u00e9e. La classification de ces mutations varie selon les crit\u00e8res des scientifiques, et ne signifie pas pour autant que les \u00ab\u00a0variants\u00a0\u00bb du virus sont radicalement diff\u00e9rentes les unes des autres, compliquant la recherche pour le vaccin ou modifiant profond\u00e9ment ses effets sur ceux qui contractent la maladie. En l’occurrence, celui du Covid a jusqu’alors peu \u00e9volu\u00e9, et ne pr\u00e9sente aucune \u00e9volution majeure dans son comportement. \u00c9voquer une \u00ab\u00a0surmutation\u00a0\u00bb<\/em>, comme le fait Didier Raoult, semble donc largement exag\u00e9r\u00e9<\/p>\n<\/section>\n<\/section>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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