Parmi les pr\u00e8s de deux millions d\u2019esp\u00e8ces d\u00e9crites, 3\u00a0000\u00a0sont des virus, 10\u00a0000\u00a0des bact\u00e9ries, 135\u00a0000\u00a0des champignons, 375\u00a0000\u00a0des plantes<\/a> and 1,3\u00a0million des animaux<\/a>. Les 27\u00a0000\u00a0restants correspondent \u00e0 plus d\u2019une dizaine de lign\u00e9es bien moins connues regroupant principalement des organismes unicellulaires eucaryotes (c\u2019est-\u00e0-dire des organismes dont l\u2019ADN est dans le noyau de la cellule), qualifi\u00e9s de protistes par Ernst Haeckel<\/a> en 1866.<\/p>\n Combien en reste-t-il \u00e0 d\u00e9couvrir\u00a0? Quelles sont-elles\u00a0? O\u00f9 se trouvent-elles\u00a0? C\u2019est \u00e0 ces grandes questions que les programmes d\u2019exploration de la biodiversit\u00e9 tentent de r\u00e9pondre.<\/p>\n Si collecter les donn\u00e9es pour r\u00e9aliser l\u2019inventaire des esp\u00e8ces est un exercice chronophage<\/a>, l\u2019enjeu majeur du travail des taxonomistes est de d\u00e9crire celles qui sont nouvellement identifi\u00e9es. Les activit\u00e9s humaines entra\u00eenent directement ou indirectement une \u00e9rosion s\u00e9v\u00e8re de la biodiversit\u00e9, dont l\u2019impact et les cons\u00e9quences sont en cours d\u2019\u00e9valuation par l\u2019IPBES<\/a>. Le d\u00e9fi actuel est donc de d\u00e9peindre la biodiversit\u00e9 avant qu\u2019elle ne s\u2019\u00e9rode davantage.<\/p>\n Estimer l\u2019ampleur du nombre d\u2019esp\u00e8ces encore inconnues sur Terre est une t\u00e2che d\u2019extrapolation complexe et empreinte d\u2019incertitudes. Apr\u00e8s avoir annonc\u00e9 une fourchette variant entre 6 et plus de 100\u00a0millions, un consensus semble s\u2019\u00e9tablir au sein de la communaut\u00e9 scientifique autour d\u2019une valeur l\u00e9g\u00e8rement en de\u00e7\u00e0 de 10\u00a0millions<\/a>, ce qui revient \u00e0 dire que 80\u00a0% des esp\u00e8ces restent \u00e0 d\u00e9crire\u00a0!<\/p>\n Sur terre, les for\u00eats sont identifi\u00e9es de tr\u00e8s longue date comme des r\u00e9servoirs de biodiversit\u00e9, notamment pour les arthropodes (parmi lesquels figurent les insectes, les mille-pattes, les arachnides et les crustac\u00e9s). Ceux-ci constituent le groupe le plus vari\u00e9 d\u2019organismes, avec pr\u00e8s d\u2019un million de taxons d\u00e9crits. De fa\u00e7on g\u00e9n\u00e9rale, les sols abritent une myriade d\u2019organismes de petite taille dont la diversit\u00e9 des esp\u00e8ces est en cours d\u2019\u00e9valuation par des techniques de metabarcoding qui permettent de d\u00e9nombrer les organismes sur la base d\u2019une s\u00e9quence de leur ADN.<\/p>\n Depuis les eaux douces comme dans les oc\u00e9ans, les milieux aquatiques sont aussi des habitats foisonnants mais moins explor\u00e9s, en raison notamment de la difficult\u00e9 \u00e0 y acc\u00e9der. L\u2019\u00e9tude des grands patrons de biodiversit\u00e9 a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que les esp\u00e8ces marines \u00e9taient les plus vari\u00e9es entre les tropiques et que leur richesse s\u2019amenuisait aux hautes latitudes<\/a>.<\/p>\n Les zones c\u00f4ti\u00e8res o\u00f9 se concentre l\u2019essentiel de la diversit\u00e9 marine subissent une forte pression anthropique. Elles n\u2019\u00e9chappent pas pour autant \u00e0 un d\u00e9ficit d\u2019exploration. La proximit\u00e9 de la terre engendre un hydrodynamisme important (courant, vagues, houle), qui rend l\u2019utilisation de moyens nautiques et d\u2019engins de p\u00eache p\u00e9rilleux et donc la collecte de sp\u00e9cimens particuli\u00e8rement difficile.<\/p>\n Quand les fonds sont meubles, il est possible d\u2019utiliser des filets et des dragues, mais lorsqu\u2019ils sont rocheux, les engins se heurtent aux asp\u00e9rit\u00e9s du relief. La plong\u00e9e scientifique<\/a> constitue alors une alternative tr\u00e8s efficace pour \u00e9chantillonner ce milieu, mais sa mise en \u0153uvre est limit\u00e9e en profondeur et dans le temps. Par cons\u00e9quent, ces techniques n\u2019ont permis d\u2019\u00e9chantillonner qu\u2019une infime partie des c\u00f4tes plan\u00e9taires.<\/p>\n Bien que la faune et la flore marine aient fait l\u2019objet de nombreuses \u00e9tudes d\u00e8s le d\u00e9but du XIXe<\/sup>\u00a0si\u00e8cle en Europe et notamment en France, la connaissance des esp\u00e8ces des fonds rocheux comporte encore d\u2019importantes lacunes.<\/p>\n Les explorations historiques ont permis la description des esp\u00e8ces qui ont servi d\u2019\u00e9chafaudage pour \u00e9tablir des classifications. Il nous appara\u00eet aujourd\u2019hui opportun de poursuivre ces explorations, avec une m\u00e9thodologie renouvel\u00e9e.<\/p>\n Le Mus\u00e9um national d\u2019Histoire naturelle a donc organis\u00e9 de nombreuses exp\u00e9ditions dans les r\u00e9gions tropicales, \u00e0 travers des programmes comme Tropical Deep-Sea benthos<\/a> and \u00ab\u00a0La plan\u00e8te revisit\u00e9e\u00a0\u00bb<\/a>, qui fouille \u00e0 travers le monde cinq points chauds de la biodiversit\u00e9, parmi lesquels la Corse.<\/p>\n Les \u00e9quipes de terrain d\u00e9ploient d\u00e9sormais des modes d\u2019\u00e9chantillonnage capables de cibler des taxons dont l\u2019\u00e9tude a \u00e9t\u00e9 n\u00e9glig\u00e9e jusqu\u2019alors. C\u2019est notamment le cas pour les mollusques, les crustac\u00e9s et les algues. Cette strat\u00e9gie d\u2019\u00e9chantillonnage implique d\u2019explorer tous les habitats d\u2019une r\u00e9gion donn\u00e9e afin de maximiser la diversit\u00e9 des esp\u00e8ces r\u00e9colt\u00e9es.<\/p>\n Sur la base des cartographies des habitats marins r\u00e9alis\u00e9es gr\u00e2ce \u00e0 des sondeurs multifaisceaux<\/a>, les organismes sont r\u00e9colt\u00e9s pour chaque lieu au moyen d\u2019aspirateurs sous-marins et de paniers de brossages qui permettent de pr\u00e9lever la faune<\/a> de taille millim\u00e9trique qu\u2019il n\u2019est pas possible de rep\u00e9rer \u00e0 l\u2019\u0153il nu lors d\u2019une plong\u00e9e.<\/p>\n Les sp\u00e9cimens sont ensuite rapport\u00e9s rapidement au laboratoire o\u00f9 ils sont tri\u00e9s par taille et par grand groupe avant d\u2019\u00eatre photographi\u00e9s vivants puis fix\u00e9s (le plus souvent dans de l\u2019alcool) pour leur pr\u00e9servation. \u00c0 l\u2019issue de l\u2019exp\u00e9dition, tous ces sp\u00e9cimens sont int\u00e9gr\u00e9s dans les collections du Mus\u00e9um et sont \u00e9tudi\u00e9s par les sp\u00e9cialistes de chaque groupe. Les donn\u00e9es d\u2019occurrence sont vers\u00e9es \u00e0 l\u2019Inventaire national du patrimoine naturel<\/a>.<\/p>\n Si une esp\u00e8ce nouvelle est d\u00e9tect\u00e9e, elle est formellement d\u00e9crite dans une publication et officiellement reconnue et d\u00e9nombr\u00e9e dans le recensement de la diversit\u00e9. Outre l\u2019impact scientifique, les grandes exp\u00e9ditions constituent un \u00e9v\u00e8nement remarquable apte \u00e0 souligner la valeur patrimoniale de la biodiversit\u00e9 et sensibiliser \u00e0 l\u2019unicit\u00e9 des territoires prospect\u00e9s. L\u2019enjeu en parall\u00e8le est de toucher un public large par des actions de m\u00e9diations scientifiques et de communication.<\/p>\n J\u2019ai pour ma part particip\u00e9 au premier volet marin de \u00ab\u00a0La plan\u00e8te revisit\u00e9e\u00a0\u00bb en Corse, qui s\u2019est d\u00e9roul\u00e9 en mai 2019. Nous nous sommes consacr\u00e9s \u00e0 l\u2019\u00e9tude du vivant jusqu\u2019\u00e0 100\u00a0m\u00e8tres de fond autour du cap Corse et des Agriates, une zone prot\u00e9g\u00e9e par le statut de Parc naturel marin<\/a>.<\/p>\n80\u00a0% des esp\u00e8ces encore \u00e0 d\u00e9couvrir<\/h2>\n
![\"\"](\"https:\/\/images.theconversation.com\/files\/359088\/original\/file-20200921-20-pm3gwr.JPG?ixlib=rb-1.1.0&q=45&auto=format&w=237&fit=clip\")
<\/a><\/p>\nLa diversit\u00e9 marine encore tr\u00e8s mal connue<\/h2>\n
Grandes exp\u00e9ditions et aspirateurs sous-marins<\/h2>\n
![\"\"](\"https:\/\/images.theconversation.com\/files\/359091\/original\/file-20200921-22-137fnud.JPG?ixlib=rb-1.1.0&q=45&auto=format&w=754&fit=clip\")
![\"\"](\"https:\/\/images.theconversation.com\/files\/359092\/original\/file-20200921-22-3n196r.JPG?ixlib=rb-1.1.0&q=45&auto=format&w=754&fit=clip\")
La faune corse pass\u00e9e au peigne fin<\/h2>\n