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![\"Virus](\"https:\/\/reporterre.net\/local\/cache-vignettes\/L720xH480\/arton22188-61c31.jpg?1612341021\")
<\/div>\nLe Covid-19 nous semble cruel, habile ou d\u00e9routant, mais ses apparents caprices r\u00e9sultent simplement de la reproduction incessante du virus responsable de la maladie, le Sars-CoV2. Pour maximiser sa transmissibilit\u00e9, il s\u2019adapte constamment \u00e0 l\u2019environnement le plus favorable pour lui, les humains\u2026 En bref, il a le comportement \u00e9cologique des organismes vivants.<\/p>\n<\/div>\n
Qu\u2019est-ce qui fait courir le Sars-CoV2\u00a0<\/small>? Comment s\u2019explique son comportement\u00a0<\/small>? La question peut se poser, \u00e0 entendre moult experts. \u00ab\u00a0<\/small>On a affaire \u00e0 un virus diabolique et beaucoup plus intelligent qu\u2019on ne le pense\u00a0<\/small>\u00bb<\/a><\/i> estime ainsi le professeur Jean-Fran\u00e7ois Delfraissy, pr\u00e9sident du conseil scientifique. D\u2019autres parlent de sa capacit\u00e9 \u00ab\u00a0<\/small>\u00e0 exploiter nos moindres failles\u00a0<\/small>\u00bb<\/i>. Ces m\u00e9taphores capturent certes l\u2019imagination mais n\u2019\u00e9clairent gu\u00e8re les choses. Car pr\u00eater une conscience malfaisante \u00e0 un virus ne permet pas de comprendre sa logique, ni les sc\u00e9narios possibles de son \u00e9volution.<\/p>\n \u00ab\u00a0<\/small>En biologie, on adore raconter des histoires et anthropomorphiser\u00a0<\/small>\u00bb<\/i>, confesse Samuel Alizon directeur de recherche au CNRS<\/span> et auteur de \u00c9volution, \u00e9cologie et pand\u00e9mies. Faire dialoguer Pasteur et Darwin<\/a><\/i>, qui vient d\u2019\u00eatre r\u00e9\u00e9dit\u00e9 en poche (Seuil, 2020). \u00ab\u00a0<\/small>Mais il faut bien \u00eatre conscient des limites de l\u2019analogie, et toujours garder \u00e0 l\u2019esprit que ce sont les r\u00e8gles de l\u2019\u00e9volution qui m\u00e8nent le jeu.\u00a0<\/small>\u00bb<\/i> Car si le Covid-19, qui est une maladie, peut parfois nous sembler cruel, habile ou d\u00e9routant, ses apparents caprices r\u00e9sultent de la reproduction aveugle d\u2019un virus, le Sars-CoV2. Cette petite machine \u00e0 se multiplier est \u00e9videmment d\u00e9pourvue de conscience, de sentiments et de pr\u00e9m\u00e9ditation. Pourquoi alors, demandera-t-on, ses brusques changements de comportements\u00a0<\/small>? Pourquoi avoir \u00ab\u00a0<\/small>saut\u00e9\u00a0<\/small>\u00bb<\/i> de l\u2019animal sauvage auquel il \u00e9tait adapt\u00e9 \u00e0 l\u2019humain\u00a0<\/small>? Pourquoi cette expansion explosive en une seule ann\u00e9e\u00a0<\/small>? Et ces mutants plus contagieux<\/a> ou plus r\u00e9sistants aux vaccins\u00a0<\/small>?<\/p>\n Toutes ces transformations sont en r\u00e9alit\u00e9 le jeu normal de l\u2019\u00e9volution des organismes, \u00e9volution acc\u00e9l\u00e9r\u00e9e dans le cas d\u2019un microbe, au cycle de vie tr\u00e8s court et \u00e0 la population innombrable. Car ce virus n\u2019est rien d\u2019autre qu\u2019un organisme, une sorte d\u2019esp\u00e8ce invasive, qui prend pied dans un nouvel environnement complexe \u2014 le corps humain. Et comme pour tout \u00eatre vivant, sans exception, le succ\u00e8s biologique pour un virus consiste \u00e0 maximiser sa reproduction et \u00e0 occuper tout son environnement \u2013 car c\u2019est ainsi que les \u00eatres vivants minimisent le risque d\u2019extinction face aux pr\u00e9dateurs et aux catastrophes qui les menacent toujours.<\/p>\n Pour maximiser cette reproduction, le virus s\u2019adapte constamment \u00e0 son environnement, am\u00e9liorant sans cesse sa biologie. Il le fait sans intentionnalit\u00e9\u00a0: son adaptation est le produit de mutations al\u00e9atoires, d\u2019erreurs de copie lorsqu\u2019il se reproduit. D\u00e8s son entr\u00e9e dans une cellule, le Sars-CoV2 fait en effet un millier de copies de lui-m\u00eame en moins de dix heures, rappelle l\u2019\u00e9volutionniste Franck Courchamp dans un article passionnant et plein de verve<\/a>, puis ces nouveaux virus sortent de la cellule et vont propager l\u2019infection plus loin. Certaines de ces copies, in\u00e9vitablement, comportent de petites erreurs\u00a0<\/small>; et l\u2019immense majorit\u00e9 des mutants disparaissent car les virus \u00ab\u00a0<\/small>ordinaires\u00a0<\/small>\u00bb<\/i> leur sont sup\u00e9rieurs. Mais de temps \u00e0 autre, une mutation cr\u00e9e un virus mieux adapt\u00e9 \u2014 par exemple qui entre plus facilement dans les cellules, ou qui \u00e9chappe mieux au syst\u00e8me immunitaire humain. C\u2019est alors lui qui \u00e9limine ses rivaux, et le nouveau virus \u00ab\u00a0<\/small>am\u00e9lior\u00e9\u00a0<\/small>\u00bb<\/i> devient la norme. Vu de l\u2019ext\u00e9rieur, le virus semble avoir man\u0153uvr\u00e9 \u00e0 son avantage, et il est tentant de d\u00e9crire les choses ainsi. En r\u00e9alit\u00e9, l\u2019\u00e9volution a tout simplement fait son travail.<\/p>\n On comprend imm\u00e9diatement l\u2019avantage biologique qu\u2019il y a pour un virus \u00e0 acqu\u00e9rir la capacit\u00e9 d\u2019infecter des humains, s\u2019il vient par exemple d\u2019une obscure esp\u00e8ce de chauve-souris localis\u00e9e dans les for\u00eats d\u2019une lointaine r\u00e9gion chinoise. \u00ab\u00a0<\/small>Rentrer\u00a0<\/small>\u00bb<\/i>dans l\u2019humanit\u00e9, faire de celle-ci son \u00ab\u00a0<\/small>environnement, son \u00e9cosyst\u00e8me et sa ressource\u00a0<\/small>\u00bb<\/i>, comme l\u2019\u00e9crit Franck Courchamp, c\u2019est s\u2019ouvrir un immense territoire biologique \u00e0 coloniser, un territoire constitu\u00e9 de milliards d\u2019individus r\u00e9pandus aux quatre coins de la plan\u00e8te et dans tous les milieux\u00a0<\/small>! On voit rarement ces sauts d\u2019esp\u00e8ces car ils ont une probabilit\u00e9 assez forte de s\u2019\u00e9teindre sans causer d\u2019\u00e9pid\u00e9mie. Mais si on multiplie les contacts entre les humains et la faune sauvage<\/a>, ou entre les animaux d\u2019\u00e9levage (constamment manipul\u00e9s par les humains) et cette faune<\/a>, on augmente le nombre de contacts entre des virus mut\u00e9s et des humains.\u00a0<\/small>\u00bb<\/p><\/blockquote>\n Et donc la probabilit\u00e9 du passage \u00e0 l\u2019humain d\u2019un virus animal.<\/p>\n L\u2019extraordinaire vitesse de propagation du Sars-CoV, qui a conquis les cinq continents en quelques semaines, s\u2019explique quant \u00e0 elle davantage par les propri\u00e9t\u00e9s de l\u2019habitat du virus, \u00e0 savoir l\u2019humanit\u00e9, que par les caract\u00e9ristiques du virus lui-m\u00eame. Certes, celui-ci est transmissible par les gouttelettes et les a\u00e9rosols, un mode de propagation tr\u00e8s efficace. Mais c\u2019est surtout l\u2019extraordinaire accroissement des transports<\/a> \u00e0 la fois intercontinentaux et domestiques (il y a eu 4,4 milliards de passagers a\u00e9riens<\/a> en 2019), ainsi que l\u2019urbanisation, \u00e9norme multiplicateur des contacts interhumains, qui ont permis la conqu\u00eate du monde par le virus. Et qui fait que m\u00eame les territoires qui semblent parvenir \u00e0 s\u2019en d\u00e9barrasser, comme ce fut le cas de la Chine ou de la Nouvelle-Z\u00e9lande, sont r\u00e9guli\u00e8rement l\u2019objet de flamb\u00e9es import\u00e9es<\/a>.<\/p>\n La multiplication des variants, elle aussi, s\u2019explique par des r\u00e8gles \u00e9cologiques de base. Dans une population d\u2019h\u00f4tes restreinte, par exemple les chauves-souris, ou une petite communaut\u00e9 d\u2019humains, les mutations sont rares. Mais le Sars-CoV2 infecte d\u00e9sormais environ cent millions d\u2019humains. D\u00e8s lors, le nombre de mutations augmente de fa\u00e7on exponentielle, et des variants mieux adapt\u00e9s apparaissent. Dans un <\/a>entretien<\/a>, le bioinformaticien sud-africain Tulio de Oliveira soulignait que le point commun entre Londres, Le Cap et Manaus \u2014 o\u00f9 sont apparus les trois variants les plus pr\u00e9occupants \u2014 est qu\u2019elles sont des villes \u00ab\u00a0<\/small>profond\u00e9ment touch\u00e9es par la premi\u00e8re vague de l\u2019infection\u00a0<\/small>\u00bb<\/i>. Tandis que l\u2019on voit bien qu\u2019il n\u2019y a pas eu de variants vietnamiens ou cor\u00e9ens \u2014 les pays qui ont bien g\u00e9r\u00e9 l\u2019\u00e9pid\u00e9mie.<\/p>\n L\u2019apparition de mutants plus transmissibles (variant britannique) ou de mutants capables de r\u00e9infecter des humains d\u00e9j\u00e0 tomb\u00e9s malades (variant sud-africain ou br\u00e9silien) est parfaitement conforme \u00e0 la th\u00e9orie de l\u2019\u00e9volution. Tout virus qui acquiert la capacit\u00e9 de se transmettre plus rapidement, dans la comp\u00e9tition qui l\u2019oppose aux virus \u00ab\u00a0<\/small>ordinaires\u00a0<\/small>\u00bb<\/i> pour coloniser les corps des humains, a une longueur d\u2019avance, gr\u00e2ce \u00e0 laquelle il finit par s\u2019imposer. Le Sars-CoV2 l\u2019a fait comme pr\u00e9vu, m\u00eame si c\u2019est \u00ab\u00a0<\/small>avec une efficacit\u00e9 stup\u00e9fiante\u00a0<\/small>\u00bb<\/a><\/i> pour Christian Drosten, le principal sp\u00e9cialiste allemand des coronavirus.<\/p>\n Mais alors pourquoi le virus nous rend-il malades, parfois fatalement\u00a0<\/small>? N\u2019est-ce pas pour lui tuer la poule aux \u0153ufs d\u2019or\u00a0<\/small>? Souvenons-nous que toute mutation qui augmente le succ\u00e8s reproducteur du virus sera s\u00e9lectionn\u00e9e par l\u2019\u00e9volution. Cela peut \u00eatre le cas de certains sympt\u00f4mes favorisant la transmission, par exemple la toux et les \u00e9ternuements, pour les virus respiratoires, ou la diarrh\u00e9e, pour les virus digestifs… Le plus souvent, le fait que l\u2019humain soit malade n\u2019est pas \u00ab\u00a0<\/small>utile\u00a0<\/small>\u00bb<\/i> au virus. La maladie r\u00e9sulte simplement de la colonisation et de la destruction rapide d\u2019un grand nombre de cellules de certains organes par le virus, contraint de se reproduire rapidement pour \u00e9viter d\u2019\u00eatre rattrap\u00e9 par le syst\u00e8me immunitaire. Parfois, comme cela arrive avec le Covid, le syst\u00e8me immunitaire d\u00e9bord\u00e9 d\u00e9clenche une riposte plus l\u00e9tale que l\u2019action du virus lui-m\u00eame. Au fond, c\u2019est la transmissibilit\u00e9 qui est s\u00e9lectionn\u00e9e par l\u2019\u00e9volution, tandis que la virulence n\u2019est qu\u2019une cons\u00e9quence plus ou moins ind\u00e9sirable de cette derni\u00e8re.<\/p>\n Faut-il en d\u00e9duire que la virulence s\u2019att\u00e9nue naturellement avec le temps par le jeu des mutations, et que le Covid va peu \u00e0 peu devenir inoffensif jusqu\u2019\u00e0 se transformer en un banal rhume (comme d\u2019autres coronavirus humains)\u00a0<\/small>? Les biologistes ont longtemps pens\u00e9 que c\u2019\u00e9tait la trajectoire logique des pathog\u00e8nes. \u00ab\u00a0<\/small>En pratique, on a bien vu que \u00e7a ne marche pas<\/i>, explique Samuel Alizon. Le [VIH<\/span>|virus de l\u2019immunod\u00e9ficience humaine], par exemple, a plut\u00f4t augment\u00e9 sa virulence depuis son apparition chez l\u2019humain. M\u00eame chose pour la tuberculose. En fait, aujourd\u2019hui, on consid\u00e8re qu\u2019il y a deux \u00e9volutions possibles\u00a0: la coexistence pacifique\u2026 ou la course aux armements.\u00a0<\/small>\u00bb<\/i> Et le Sars-CoV2, qui est un virus r\u00e9cent et encore imparfaitement adapt\u00e9, pourrait devenir plus virulent, dans son effort pour devenir plus transmissible.<\/p>\n Quid des traitements et des vaccins\u00a0<\/small>? Comment peuvent-ils influer sur l\u2019\u00e9volution des virus et en particulier du Sars-CoV2\u00a0<\/small>? \u00ab\u00a0<\/small>Exactement de la m\u00eame mani\u00e8re qu\u2019un pesticide influe sur l\u2019\u00e9volution d\u2019un ravageur<\/i>, r\u00e9pond Samuel Alizon. En g\u00e9n\u00e9rant des r\u00e9sistances\u00a0<\/small>; m\u00eame si les vaccins les provoquent moins rapidement que les traitements.\u00a0<\/small>\u00bb<\/i> Ainsi \u00e0 chaque nouvelle mol\u00e9cule antivirale, dans le cas du VIH<\/span>, des r\u00e9sistances sont apparues en quelques mois, et il a fallu en combiner trois pour tenir enfin le virus en respect. Il faut donc s\u2019attendre, en cas d\u2019apparition d\u2019antiviraux efficaces contre le Sars-CoV2, \u00e0 devoir d\u00e9velopper des strat\u00e9gies de combinaisons ou d\u2019alternances de traitements pour \u00e9viter que le virus ne parvienne \u00e0 leur \u00e9chapper.<\/p>\nSi ce virus nous a \u00ab\u00a0<\/small>saut\u00e9 dessus\u00a0<\/small>\u00bb, c\u2019est que nos comportements lui en ont fourni l\u2019occasion<\/h3>\n
Il n\u2019en reste pas moins que si ce virus nous a \u00ab\u00a0<\/small>saut\u00e9 dessus\u00a0<\/small>\u00bb<\/i>, c\u2019est que nos comportements lui en ont fourni l\u2019occasion, notamment notre incessante conqu\u00eate de nouveaux milieux naturels. L\u2019humanit\u00e9 s\u2019\u00e9tait du reste longtemps tenue \u00e0 distance des for\u00eats tropicales pr\u00e9cis\u00e9ment \u00e0 cause des nombreuses maladies qu\u2019on y contractait. Samuel Alizon souligne\u00a0:<\/p>\n\n
![\"\"](\"https:\/\/reporterre.net\/local\/cache-vignettes\/L720xH405\/airport-5078694_1280-3b286.jpg?1612341039\")
<\/a><\/dt>\n\u00ab\u00a0<\/small>Il y a deux \u00e9volutions possibles\u00a0: la coexistence pacifique\u2026 ou la course aux armements\u00a0<\/small>\u00bb<\/h3>\n